Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q71RC1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q71RC1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q71RC1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q71RC1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q71RC1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q71RC1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q71RC1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q71RC1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Q71RC1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q71RC1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q71RC1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q71RC1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q71RC1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q71RC1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q71RC1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q71RC1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Q71RC1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q71RC1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q71RC1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q71RC1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q71RC1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q71RC1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q71RC1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q71RC1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q71RC1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Q71RC1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q71RC1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q71RC1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q71RC1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q71RC1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q71RC1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q71RC1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q71RC1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q71RC1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Q71RC1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q71RC1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q71RC1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q71RC1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Q71RC1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q71RC1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q71RC1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q71RC1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q71RC1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q71RC1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q71RC1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q71RC1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q71RC1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q71RC1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q71RC1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q71RC1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q71RC1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q71RC1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q71RC1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q71RC1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q71RC1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q71RC1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q71RC1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q71RC1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q71RC1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q71RC1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q71RC1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q71RC1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q71RC1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q71RC1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q71RC1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q71RC1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q71RC1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q71RC1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q71RC1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q71RC1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q71RC1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q71RC1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q71RC1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q71RC1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q71RC1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q71RC1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q71RC1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q71RC1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q71RC1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q71RC1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q71RC1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms