Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
C12orf60Q5U649 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.67
C12orf60Q5U649 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
C12orf60Q5U649 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
C12orf60Q5U649 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
C12orf60Q5U649 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
C12orf60Q5U649 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
C12orf60Q5U649 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
C12orf60Q5U649 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
C12orf60Q5U649 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
C12orf60Q5U649 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
C12orf60Q5U649 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
C12orf60Q5U649 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
C12orf60Q5U649 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
C12orf60Q5U649 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
C12orf60Q5U649 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
C12orf60Q5U649 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
C12orf60Q5U649 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
C12orf60Q5U649 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
C12orf60Q5U649 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
C12orf60Q5U649 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
C12orf60Q5U649 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
C12orf60Q5U649 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
C12orf60Q5U649 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
C12orf60Q5U649 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
C12orf60Q5U649 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
C12orf60Q5U649 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
C12orf60Q5U649 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
C12orf60Q5U649 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
C12orf60Q5U649 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
C12orf60Q5U649 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
C12orf60Q5U649 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
C12orf60Q5U649 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
C12orf60Q5U649 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
C12orf60Q5U649 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
C12orf60Q5U649 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
C12orf60Q5U649 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
C12orf60Q5U649 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
C12orf60Q5U649 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
C12orf60Q5U649 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
C12orf60Q5U649 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
C12orf60Q5U649 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
C12orf60Q5U649 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
C12orf60Q5U649 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
C12orf60Q5U649 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
C12orf60Q5U649 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
C12orf60Q5U649 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
C12orf60Q5U649 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
C12orf60Q5U649 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
C12orf60Q5U649 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
C12orf60Q5U649 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
C12orf60Q5U649 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
C12orf60Q5U649 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
C12orf60Q5U649 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
C12orf60Q5U649 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
C12orf60Q5U649 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
C12orf60Q5U649 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
C12orf60Q5U649 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
C12orf60Q5U649 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
C12orf60Q5U649 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
C12orf60Q5U649 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
C12orf60Q5U649 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
C12orf60Q5U649 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
C12orf60Q5U649 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
C12orf60Q5U649 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
C12orf60Q5U649 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
C12orf60Q5U649 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
C12orf60Q5U649 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
C12orf60Q5U649 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
C12orf60Q5U649 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
C12orf60Q5U649 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
C12orf60Q5U649 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
C12orf60Q5U649 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
C12orf60Q5U649 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
C12orf60Q5U649 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
C12orf60Q5U649 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
C12orf60Q5U649 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
C12orf60Q5U649 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
C12orf60Q5U649 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
C12orf60Q5U649 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.9 ms