Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP21-3Q3LHN1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP21-3Q3LHN1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP21-3Q3LHN1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP21-3Q3LHN1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP21-3Q3LHN1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRTAP21-3Q3LHN1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRTAP21-3Q3LHN1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRTAP21-3Q3LHN1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRTAP21-3Q3LHN1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP21-3Q3LHN1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP21-3Q3LHN1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP21-3Q3LHN1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRTAP21-3Q3LHN1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP21-3Q3LHN1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP21-3Q3LHN1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP21-3Q3LHN1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP21-3Q3LHN1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP21-3Q3LHN1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP21-3Q3LHN1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP21-3Q3LHN1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP21-3Q3LHN1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP21-3Q3LHN1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP21-3Q3LHN1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRTAP21-3Q3LHN1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KRTAP21-3Q3LHN1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRTAP21-3Q3LHN1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRTAP21-3Q3LHN1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRTAP21-3Q3LHN1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP21-3Q3LHN1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KRTAP21-3Q3LHN1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRTAP21-3Q3LHN1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRTAP21-3Q3LHN1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRTAP21-3Q3LHN1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRTAP21-3Q3LHN1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRTAP21-3Q3LHN1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRTAP21-3Q3LHN1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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