Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC96Q2M329 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC96Q2M329 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC96Q2M329 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC96Q2M329 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC96Q2M329 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC96Q2M329 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC96Q2M329 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC96Q2M329 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC96Q2M329 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC96Q2M329 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC96Q2M329 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC96Q2M329 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC96Q2M329 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC96Q2M329 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC96Q2M329 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC96Q2M329 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC96Q2M329 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC96Q2M329 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC96Q2M329 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC96Q2M329 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC96Q2M329 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC96Q2M329 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC96Q2M329 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC96Q2M329 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC96Q2M329 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC96Q2M329 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC96Q2M329 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCDC96Q2M329 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC96Q2M329 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC96Q2M329 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC96Q2M329 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC96Q2M329 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC96Q2M329 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC96Q2M329 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC96Q2M329 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC96Q2M329 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC96Q2M329 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC96Q2M329 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC96Q2M329 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC96Q2M329 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC96Q2M329 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC96Q2M329 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC96Q2M329 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC96Q2M329 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC96Q2M329 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC96Q2M329 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC96Q2M329 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC96Q2M329 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC96Q2M329 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC96Q2M329 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC96Q2M329 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC96Q2M329 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC96Q2M329 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC96Q2M329 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC96Q2M329 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC96Q2M329 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC96Q2M329 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC96Q2M329 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC96Q2M329 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC96Q2M329 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC96Q2M329 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC96Q2M329 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC96Q2M329 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC96Q2M329 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC96Q2M329 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC96Q2M329 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC96Q2M329 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC96Q2M329 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC96Q2M329 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC96Q2M329 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC96Q2M329 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC96Q2M329 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC96Q2M329 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC96Q2M329 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC96Q2M329 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC96Q2M329 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC96Q2M329 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC96Q2M329 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC96Q2M329 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC96Q2M329 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CCDC96Q2M329 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC96Q2M329 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC96Q2M329 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC96Q2M329 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC96Q2M329 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC96Q2M329 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC96Q2M329 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC96Q2M329 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC96Q2M329 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC96Q2M329 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC96Q2M329 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC96Q2M329 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC96Q2M329 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC96Q2M329 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC96Q2M329 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC96Q2M329 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC96Q2M329 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC96Q2M329 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC96Q2M329 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms