Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIP11Q15643 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIP11Q15643 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIP11Q15643 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIP11Q15643 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIP11Q15643 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIP11Q15643 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIP11Q15643 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIP11Q15643 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIP11Q15643 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIP11Q15643 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIP11Q15643 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIP11Q15643 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIP11Q15643 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIP11Q15643 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIP11Q15643 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIP11Q15643 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIP11Q15643 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIP11Q15643 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIP11Q15643 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIP11Q15643 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIP11Q15643 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIP11Q15643 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIP11Q15643 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIP11Q15643 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIP11Q15643 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIP11Q15643 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIP11Q15643 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIP11Q15643 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIP11Q15643 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIP11Q15643 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIP11Q15643 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIP11Q15643 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIP11Q15643 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIP11Q15643 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIP11Q15643 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIP11Q15643 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIP11Q15643 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIP11Q15643 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIP11Q15643 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIP11Q15643 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIP11Q15643 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIP11Q15643 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIP11Q15643 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIP11Q15643 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIP11Q15643 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRIP11Q15643 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
TRIP11Q15643 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIP11Q15643 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIP11Q15643 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIP11Q15643 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIP11Q15643 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms