Protein–RNA interactions for Protein: Q14766

LTBP1, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP1Q14766 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LTBP1Q14766 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LTBP1Q14766 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LTBP1Q14766 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LTBP1Q14766 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LTBP1Q14766 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
LTBP1Q14766 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LTBP1Q14766 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LTBP1Q14766 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LTBP1Q14766 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
LTBP1Q14766 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LTBP1Q14766 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LTBP1Q14766 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
LTBP1Q14766 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LTBP1Q14766 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
LTBP1Q14766 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LTBP1Q14766 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LTBP1Q14766 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LTBP1Q14766 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LTBP1Q14766 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LTBP1Q14766 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms