Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MDC1Q14676 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDC1Q14676 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDC1Q14676 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDC1Q14676 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDC1Q14676 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDC1Q14676 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDC1Q14676 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MDC1Q14676 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MDC1Q14676 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MDC1Q14676 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MDC1Q14676 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MDC1Q14676 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MDC1Q14676 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDC1Q14676 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDC1Q14676 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDC1Q14676 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDC1Q14676 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDC1Q14676 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDC1Q14676 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDC1Q14676 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDC1Q14676 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDC1Q14676 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MDC1Q14676 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MDC1Q14676 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDC1Q14676 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDC1Q14676 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDC1Q14676 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MDC1Q14676 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MDC1Q14676 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MDC1Q14676 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDC1Q14676 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDC1Q14676 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDC1Q14676 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MDC1Q14676 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MDC1Q14676 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MDC1Q14676 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDC1Q14676 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDC1Q14676 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDC1Q14676 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDC1Q14676 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MDC1Q14676 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MDC1Q14676 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MDC1Q14676 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MDC1Q14676 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MDC1Q14676 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MDC1Q14676 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MDC1Q14676 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDC1Q14676 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDC1Q14676 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDC1Q14676 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDC1Q14676 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDC1Q14676 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDC1Q14676 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MDC1Q14676 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDC1Q14676 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDC1Q14676 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDC1Q14676 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDC1Q14676 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDC1Q14676 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDC1Q14676 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MDC1Q14676 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDC1Q14676 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDC1Q14676 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MDC1Q14676 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MDC1Q14676 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDC1Q14676 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MDC1Q14676 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MDC1Q14676 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDC1Q14676 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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