Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BNC1Q01954 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BNC1Q01954 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
BNC1Q01954 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BNC1Q01954 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BNC1Q01954 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BNC1Q01954 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BNC1Q01954 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BNC1Q01954 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BNC1Q01954 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BNC1Q01954 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BNC1Q01954 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BNC1Q01954 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
BNC1Q01954 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BNC1Q01954 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BNC1Q01954 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BNC1Q01954 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BNC1Q01954 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BNC1Q01954 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BNC1Q01954 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BNC1Q01954 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BNC1Q01954 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BNC1Q01954 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BNC1Q01954 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BNC1Q01954 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BNC1Q01954 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BNC1Q01954 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BNC1Q01954 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BNC1Q01954 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BNC1Q01954 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BNC1Q01954 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
BNC1Q01954 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
BNC1Q01954 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
BNC1Q01954 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BNC1Q01954 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BNC1Q01954 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BNC1Q01954 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BNC1Q01954 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BNC1Q01954 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BNC1Q01954 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BNC1Q01954 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BNC1Q01954 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BNC1Q01954 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BNC1Q01954 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BNC1Q01954 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BNC1Q01954 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BNC1Q01954 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BNC1Q01954 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BNC1Q01954 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BNC1Q01954 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BNC1Q01954 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BNC1Q01954 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BNC1Q01954 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
BNC1Q01954 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BNC1Q01954 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BNC1Q01954 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BNC1Q01954 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BNC1Q01954 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BNC1Q01954 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BNC1Q01954 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BNC1Q01954 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BNC1Q01954 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BNC1Q01954 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BNC1Q01954 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BNC1Q01954 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BNC1Q01954 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BNC1Q01954 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BNC1Q01954 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BNC1Q01954 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BNC1Q01954 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BNC1Q01954 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BNC1Q01954 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BNC1Q01954 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BNC1Q01954 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BNC1Q01954 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BNC1Q01954 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms