Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPPLY3P57055 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPPLY3P57055 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPPLY3P57055 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPPLY3P57055 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIPPLY3P57055 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPPLY3P57055 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPPLY3P57055 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPPLY3P57055 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPPLY3P57055 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPPLY3P57055 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPPLY3P57055 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPPLY3P57055 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPPLY3P57055 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPPLY3P57055 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPPLY3P57055 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPPLY3P57055 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPPLY3P57055 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPPLY3P57055 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIPPLY3P57055 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPPLY3P57055 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPPLY3P57055 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPPLY3P57055 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPPLY3P57055 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPPLY3P57055 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPPLY3P57055 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPPLY3P57055 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPPLY3P57055 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPPLY3P57055 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPPLY3P57055 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPPLY3P57055 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPPLY3P57055 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPPLY3P57055 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPPLY3P57055 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPPLY3P57055 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPPLY3P57055 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPPLY3P57055 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPPLY3P57055 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPPLY3P57055 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPPLY3P57055 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPPLY3P57055 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPPLY3P57055 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPPLY3P57055 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPPLY3P57055 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPPLY3P57055 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPPLY3P57055 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPPLY3P57055 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPPLY3P57055 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPPLY3P57055 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPPLY3P57055 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPPLY3P57055 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPPLY3P57055 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPPLY3P57055 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPPLY3P57055 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms