Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
UTRNP46939 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
UTRNP46939 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
UTRNP46939 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
UTRNP46939 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
UTRNP46939 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
UTRNP46939 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
UTRNP46939 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
UTRNP46939 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
UTRNP46939 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
UTRNP46939 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
UTRNP46939 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
UTRNP46939 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
UTRNP46939 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
UTRNP46939 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
UTRNP46939 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
UTRNP46939 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
UTRNP46939 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
UTRNP46939 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.01
UTRNP46939 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
UTRNP46939 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
UTRNP46939 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
UTRNP46939 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
UTRNP46939 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
UTRNP46939 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
UTRNP46939 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
UTRNP46939 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
UTRNP46939 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
UTRNP46939 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
UTRNP46939 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
UTRNP46939 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
UTRNP46939 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
UTRNP46939 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
UTRNP46939 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
UTRNP46939 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
UTRNP46939 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
UTRNP46939 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
UTRNP46939 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.76■■■■□ 3
UTRNP46939 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.76■■■■□ 3
UTRNP46939 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.76■■■■□ 3
UTRNP46939 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.76■■■■□ 3
UTRNP46939 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.76■■■■□ 3
UTRNP46939 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.76■■■■□ 3
UTRNP46939 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.76■■■■□ 3
UTRNP46939 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.76■■■■□ 3
UTRNP46939 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.76■■■■□ 3
UTRNP46939 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
UTRNP46939 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
UTRNP46939 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
UTRNP46939 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
UTRNP46939 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
UTRNP46939 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
UTRNP46939 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
UTRNP46939 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
UTRNP46939 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
UTRNP46939 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
UTRNP46939 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
UTRNP46939 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
UTRNP46939 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
UTRNP46939 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
UTRNP46939 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
UTRNP46939 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
UTRNP46939 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
UTRNP46939 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
UTRNP46939 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
UTRNP46939 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
UTRNP46939 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
UTRNP46939 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
UTRNP46939 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
UTRNP46939 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
UTRNP46939 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
UTRNP46939 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
UTRNP46939 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
UTRNP46939 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
UTRNP46939 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
UTRNP46939 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
UTRNP46939 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
UTRNP46939 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
UTRNP46939 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
UTRNP46939 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
UTRNP46939 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UTRNP46939 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UTRNP46939 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
UTRNP46939 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
UTRNP46939 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
UTRNP46939 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
UTRNP46939 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
UTRNP46939 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
UTRNP46939 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
UTRNP46939 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
UTRNP46939 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
UTRNP46939 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
UTRNP46939 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
UTRNP46939 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
UTRNP46939 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
UTRNP46939 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
UTRNP46939 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
UTRNP46939 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
UTRNP46939 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
UTRNP46939 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms