Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATRXP46100 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATRXP46100 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATRXP46100 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATRXP46100 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRXP46100 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRXP46100 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRXP46100 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATRXP46100 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRXP46100 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATRXP46100 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATRXP46100 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATRXP46100 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATRXP46100 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATRXP46100 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATRXP46100 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATRXP46100 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATRXP46100 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATRXP46100 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATRXP46100 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATRXP46100 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATRXP46100 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATRXP46100 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATRXP46100 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATRXP46100 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATRXP46100 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATRXP46100 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATRXP46100 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATRXP46100 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATRXP46100 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATRXP46100 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATRXP46100 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATRXP46100 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATRXP46100 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATRXP46100 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATRXP46100 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATRXP46100 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATRXP46100 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATRXP46100 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATRXP46100 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATRXP46100 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATRXP46100 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRXP46100 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRXP46100 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRXP46100 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRXP46100 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATRXP46100 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRXP46100 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRXP46100 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATRXP46100 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATRXP46100 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATRXP46100 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATRXP46100 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATRXP46100 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRXP46100 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRXP46100 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRXP46100 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRXP46100 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRXP46100 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATRXP46100 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATRXP46100 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATRXP46100 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ATRXP46100 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRXP46100 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRXP46100 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRXP46100 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATRXP46100 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATRXP46100 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATRXP46100 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRXP46100 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRXP46100 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRXP46100 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRXP46100 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRXP46100 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATRXP46100 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATRXP46100 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATRXP46100 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATRXP46100 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATRXP46100 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATRXP46100 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATRXP46100 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATRXP46100 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATRXP46100 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATRXP46100 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATRXP46100 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATRXP46100 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATRXP46100 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATRXP46100 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATRXP46100 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRXP46100 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRXP46100 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRXP46100 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRXP46100 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRXP46100 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRXP46100 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRXP46100 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRXP46100 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRXP46100 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRXP46100 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRXP46100 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms