Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMA2P24043 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMA2P24043 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMA2P24043 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMA2P24043 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMA2P24043 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMA2P24043 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMA2P24043 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMA2P24043 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMA2P24043 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMA2P24043 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMA2P24043 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMA2P24043 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMA2P24043 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMA2P24043 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMA2P24043 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMA2P24043 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMA2P24043 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMA2P24043 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMA2P24043 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMA2P24043 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMA2P24043 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMA2P24043 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMA2P24043 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMA2P24043 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMA2P24043 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LAMA2P24043 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMA2P24043 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMA2P24043 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMA2P24043 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMA2P24043 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMA2P24043 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMA2P24043 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMA2P24043 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMA2P24043 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMA2P24043 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMA2P24043 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMA2P24043 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMA2P24043 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMA2P24043 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMA2P24043 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
LAMA2P24043 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMA2P24043 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMA2P24043 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMA2P24043 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMA2P24043 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMA2P24043 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMA2P24043 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMA2P24043 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMA2P24043 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMA2P24043 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMA2P24043 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMA2P24043 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMA2P24043 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMA2P24043 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMA2P24043 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMA2P24043 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMA2P24043 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMA2P24043 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMA2P24043 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMA2P24043 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMA2P24043 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMA2P24043 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMA2P24043 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMA2P24043 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMA2P24043 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMA2P24043 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMA2P24043 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMA2P24043 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMA2P24043 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LAMA2P24043 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMA2P24043 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMA2P24043 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMA2P24043 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMA2P24043 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMA2P24043 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
LAMA2P24043 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LAMA2P24043 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMA2P24043 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMA2P24043 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms