Protein–RNA interactions for Protein: P22735

TGM1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM1P22735 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TGM1P22735 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TGM1P22735 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TGM1P22735 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TGM1P22735 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TGM1P22735 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TGM1P22735 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TGM1P22735 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TGM1P22735 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TGM1P22735 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TGM1P22735 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TGM1P22735 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TGM1P22735 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TGM1P22735 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TGM1P22735 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TGM1P22735 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TGM1P22735 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TGM1P22735 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TGM1P22735 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TGM1P22735 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TGM1P22735 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TGM1P22735 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TGM1P22735 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TGM1P22735 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TGM1P22735 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TGM1P22735 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TGM1P22735 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TGM1P22735 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGM1P22735 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGM1P22735 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TGM1P22735 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TGM1P22735 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TGM1P22735 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TGM1P22735 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TGM1P22735 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TGM1P22735 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TGM1P22735 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TGM1P22735 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TGM1P22735 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TGM1P22735 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TGM1P22735 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TGM1P22735 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TGM1P22735 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TGM1P22735 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TGM1P22735 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TGM1P22735 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TGM1P22735 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TGM1P22735 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TGM1P22735 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGM1P22735 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGM1P22735 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGM1P22735 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGM1P22735 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGM1P22735 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGM1P22735 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGM1P22735 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGM1P22735 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TGM1P22735 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGM1P22735 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGM1P22735 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TGM1P22735 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TGM1P22735 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TGM1P22735 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TGM1P22735 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TGM1P22735 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TGM1P22735 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TGM1P22735 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TGM1P22735 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TGM1P22735 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TGM1P22735 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TGM1P22735 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TGM1P22735 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TGM1P22735 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TGM1P22735 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TGM1P22735 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TGM1P22735 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TGM1P22735 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TGM1P22735 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TGM1P22735 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TGM1P22735 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TGM1P22735 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TGM1P22735 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TGM1P22735 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TGM1P22735 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TGM1P22735 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TGM1P22735 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TGM1P22735 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TGM1P22735 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TGM1P22735 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TGM1P22735 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TGM1P22735 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TGM1P22735 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TGM1P22735 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TGM1P22735 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TGM1P22735 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TGM1P22735 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TGM1P22735 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TGM1P22735 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TGM1P22735 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TGM1P22735 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms