Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ERBB3P21860 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ERBB3P21860 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ERBB3P21860 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ERBB3P21860 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ERBB3P21860 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ERBB3P21860 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ERBB3P21860 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ERBB3P21860 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ERBB3P21860 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ERBB3P21860 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ERBB3P21860 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ERBB3P21860 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
ERBB3P21860 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
ERBB3P21860 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
ERBB3P21860 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
ERBB3P21860 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ERBB3P21860 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ERBB3P21860 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ERBB3P21860 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ERBB3P21860 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ERBB3P21860 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ERBB3P21860 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
ERBB3P21860 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
ERBB3P21860 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ERBB3P21860 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ERBB3P21860 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
ERBB3P21860 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
ERBB3P21860 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ERBB3P21860 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ERBB3P21860 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ERBB3P21860 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ERBB3P21860 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ERBB3P21860 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ERBB3P21860 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
ERBB3P21860 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
ERBB3P21860 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ERBB3P21860 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ERBB3P21860 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ERBB3P21860 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ERBB3P21860 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ERBB3P21860 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ERBB3P21860 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ERBB3P21860 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ERBB3P21860 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
ERBB3P21860 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
ERBB3P21860 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
ERBB3P21860 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ERBB3P21860 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ERBB3P21860 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ERBB3P21860 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ERBB3P21860 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ERBB3P21860 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ERBB3P21860 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ERBB3P21860 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ERBB3P21860 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ERBB3P21860 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ERBB3P21860 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ERBB3P21860 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ERBB3P21860 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ERBB3P21860 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
ERBB3P21860 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ERBB3P21860 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ERBB3P21860 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ERBB3P21860 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ERBB3P21860 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
ERBB3P21860 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ERBB3P21860 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ERBB3P21860 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ERBB3P21860 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ERBB3P21860 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ERBB3P21860 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERBB3P21860 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERBB3P21860 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERBB3P21860 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERBB3P21860 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERBB3P21860 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ERBB3P21860 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ERBB3P21860 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERBB3P21860 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ERBB3P21860 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ERBB3P21860 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ERBB3P21860 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERBB3P21860 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERBB3P21860 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ERBB3P21860 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ERBB3P21860 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ERBB3P21860 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ERBB3P21860 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ERBB3P21860 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERBB3P21860 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ERBB3P21860 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERBB3P21860 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERBB3P21860 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERBB3P21860 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERBB3P21860 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
ERBB3P21860 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
ERBB3P21860 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
ERBB3P21860 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ERBB3P21860 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms