Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRB1P04280 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRB1P04280 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRB1P04280 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRB1P04280 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRB1P04280 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRB1P04280 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRB1P04280 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRB1P04280 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRB1P04280 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRB1P04280 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRB1P04280 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRB1P04280 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRB1P04280 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRB1P04280 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRB1P04280 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRB1P04280 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRB1P04280 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRB1P04280 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRB1P04280 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRB1P04280 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRB1P04280 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRB1P04280 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRB1P04280 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRB1P04280 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRB1P04280 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRB1P04280 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRB1P04280 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRB1P04280 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRB1P04280 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRB1P04280 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRB1P04280 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRB1P04280 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRB1P04280 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRB1P04280 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRB1P04280 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRB1P04280 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRB1P04280 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRB1P04280 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRB1P04280 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRB1P04280 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRB1P04280 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRB1P04280 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRB1P04280 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRB1P04280 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRB1P04280 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRB1P04280 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRB1P04280 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRB1P04280 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRB1P04280 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRB1P04280 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRB1P04280 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRB1P04280 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRB1P04280 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRB1P04280 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRB1P04280 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRB1P04280 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRB1P04280 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRB1P04280 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRB1P04280 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRB1P04280 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PRB1P04280 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRB1P04280 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRB1P04280 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRB1P04280 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRB1P04280 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRB1P04280 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRB1P04280 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRB1P04280 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRB1P04280 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRB1P04280 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRB1P04280 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRB1P04280 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRB1P04280 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRB1P04280 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRB1P04280 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRB1P04280 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRB1P04280 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRB1P04280 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRB1P04280 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRB1P04280 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRB1P04280 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRB1P04280 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRB1P04280 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRB1P04280 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRB1P04280 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRB1P04280 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRB1P04280 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRB1P04280 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRB1P04280 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRB1P04280 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRB1P04280 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRB1P04280 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRB1P04280 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRB1P04280 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRB1P04280 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRB1P04280 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRB1P04280 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRB1P04280 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRB1P04280 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms