Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ECM2O94769 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ECM2O94769 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ECM2O94769 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ECM2O94769 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ECM2O94769 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
ECM2O94769 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ECM2O94769 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ECM2O94769 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ECM2O94769 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
ECM2O94769 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ECM2O94769 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ECM2O94769 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ECM2O94769 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ECM2O94769 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ECM2O94769 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ECM2O94769 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ECM2O94769 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ECM2O94769 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ECM2O94769 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ECM2O94769 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ECM2O94769 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ECM2O94769 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ECM2O94769 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ECM2O94769 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ECM2O94769 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ECM2O94769 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ECM2O94769 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ECM2O94769 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ECM2O94769 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ECM2O94769 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ECM2O94769 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ECM2O94769 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ECM2O94769 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ECM2O94769 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ECM2O94769 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ECM2O94769 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ECM2O94769 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ECM2O94769 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ECM2O94769 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ECM2O94769 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ECM2O94769 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ECM2O94769 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ECM2O94769 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ECM2O94769 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ECM2O94769 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ECM2O94769 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ECM2O94769 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ECM2O94769 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ECM2O94769 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ECM2O94769 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ECM2O94769 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ECM2O94769 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ECM2O94769 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ECM2O94769 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ECM2O94769 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ECM2O94769 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ECM2O94769 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ECM2O94769 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ECM2O94769 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ECM2O94769 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ECM2O94769 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ECM2O94769 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ECM2O94769 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ECM2O94769 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ECM2O94769 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ECM2O94769 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ECM2O94769 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ECM2O94769 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ECM2O94769 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ECM2O94769 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ECM2O94769 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ECM2O94769 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ECM2O94769 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ECM2O94769 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ECM2O94769 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ECM2O94769 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ECM2O94769 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ECM2O94769 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ECM2O94769 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ECM2O94769 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ECM2O94769 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ECM2O94769 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ECM2O94769 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ECM2O94769 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ECM2O94769 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ECM2O94769 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ECM2O94769 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ECM2O94769 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ECM2O94769 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ECM2O94769 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ECM2O94769 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ECM2O94769 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ECM2O94769 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ECM2O94769 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ECM2O94769 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ECM2O94769 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ECM2O94769 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ECM2O94769 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ECM2O94769 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms