Protein–RNA interactions for Protein: O75581

LRP6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6O75581 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
LRP6O75581 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
LRP6O75581 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
LRP6O75581 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
LRP6O75581 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
LRP6O75581 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
LRP6O75581 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
LRP6O75581 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
LRP6O75581 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
LRP6O75581 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
LRP6O75581 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
LRP6O75581 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
LRP6O75581 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
LRP6O75581 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
LRP6O75581 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
LRP6O75581 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
LRP6O75581 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRP6O75581 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
LRP6O75581 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
LRP6O75581 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
LRP6O75581 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
LRP6O75581 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
LRP6O75581 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRP6O75581 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRP6O75581 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRP6O75581 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
LRP6O75581 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
LRP6O75581 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
LRP6O75581 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
LRP6O75581 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRP6O75581 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRP6O75581 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRP6O75581 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
LRP6O75581 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
LRP6O75581 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
LRP6O75581 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
LRP6O75581 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
LRP6O75581 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
LRP6O75581 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
LRP6O75581 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
LRP6O75581 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
LRP6O75581 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
LRP6O75581 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
LRP6O75581 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
LRP6O75581 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRP6O75581 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRP6O75581 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRP6O75581 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRP6O75581 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
LRP6O75581 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
LRP6O75581 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
LRP6O75581 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
LRP6O75581 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
LRP6O75581 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
LRP6O75581 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
LRP6O75581 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
LRP6O75581 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
LRP6O75581 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
LRP6O75581 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
LRP6O75581 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRP6O75581 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRP6O75581 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRP6O75581 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
LRP6O75581 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
LRP6O75581 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
LRP6O75581 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
LRP6O75581 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
LRP6O75581 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRP6O75581 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRP6O75581 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRP6O75581 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRP6O75581 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRP6O75581 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRP6O75581 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRP6O75581 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRP6O75581 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRP6O75581 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRP6O75581 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
LRP6O75581 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
LRP6O75581 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
LRP6O75581 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
LRP6O75581 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
LRP6O75581 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
LRP6O75581 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
LRP6O75581 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
LRP6O75581 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
LRP6O75581 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
LRP6O75581 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
LRP6O75581 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
LRP6O75581 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
LRP6O75581 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
LRP6O75581 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
LRP6O75581 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
LRP6O75581 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LRP6O75581 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LRP6O75581 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LRP6O75581 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LRP6O75581 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LRP6O75581 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
LRP6O75581 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms