Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC55.51■■■■■ 6.48
ABCC9O60706 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC55.5■■■■■ 6.47
ABCC9O60706 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.49■■■■■ 6.47
ABCC9O60706 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC55.49■■■■■ 6.47
ABCC9O60706 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC55.46■■■■■ 6.47
ABCC9O60706 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC55.46■■■■■ 6.47
ABCC9O60706 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.44■■■■■ 6.47
ABCC9O60706 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.43■■■■■ 6.46
ABCC9O60706 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC55.43■■■■■ 6.46
ABCC9O60706 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC55.4■■■■■ 6.46
ABCC9O60706 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.39■■■■■ 6.46
ABCC9O60706 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC55.38■■■■■ 6.46
ABCC9O60706 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC55.33■■■■■ 6.45
ABCC9O60706 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC55.3■■■■■ 6.44
ABCC9O60706 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.28■■■■■ 6.44
ABCC9O60706 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC55.28■■■■■ 6.44
ABCC9O60706 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.28■■■■■ 6.44
ABCC9O60706 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC55.27■■■■■ 6.44
ABCC9O60706 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC55.24■■■■■ 6.43
ABCC9O60706 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC55.23■■■■■ 6.43
ABCC9O60706 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC55.21■■■■■ 6.43
ABCC9O60706 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC55.19■■■■■ 6.43
ABCC9O60706 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC55.19■■■■■ 6.43
ABCC9O60706 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC55.18■■■■■ 6.42
ABCC9O60706 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC55.18■■■■■ 6.42
ABCC9O60706 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC55.17■■■■■ 6.42
ABCC9O60706 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC55.17■■■■■ 6.42
ABCC9O60706 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.13■■■■■ 6.42
ABCC9O60706 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC55.13■■■■■ 6.42
ABCC9O60706 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.11■■■■■ 6.41
ABCC9O60706 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC55.11■■■■■ 6.41
ABCC9O60706 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.09■■■■■ 6.41
ABCC9O60706 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC55.08■■■■■ 6.41
ABCC9O60706 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC55.07■■■■■ 6.41
ABCC9O60706 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.07■■■■■ 6.41
ABCC9O60706 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC55.07■■■■■ 6.41
ABCC9O60706 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.07■■■■■ 6.41
ABCC9O60706 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.07■■■■■ 6.41
ABCC9O60706 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC55.06■■■■■ 6.41
ABCC9O60706 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.06■■■■■ 6.4
ABCC9O60706 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC55.05■■■■■ 6.4
ABCC9O60706 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.04■■■■■ 6.4
ABCC9O60706 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC55.04■■■■■ 6.4
ABCC9O60706 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC55.03■■■■■ 6.4
ABCC9O60706 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.01■■■■■ 6.4
ABCC9O60706 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC55■■■■■ 6.4
ABCC9O60706 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.99■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.98■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC54.98■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.97■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC54.97■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC54.96■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC54.96■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC54.96■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC54.96■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC54.96■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC54.96■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC54.96■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC54.96■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC54.96■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC54.96■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC54.96■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.95■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC54.95■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC54.95■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC54.94■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC54.94■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC54.94■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC54.94■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC54.94■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC54.94■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.94■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.94■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.94■■■■■ 6.39
ABCC9O60706 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC54.92■■■■■ 6.38
ABCC9O60706 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.89■■■■■ 6.38
ABCC9O60706 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.88■■■■■ 6.38
ABCC9O60706 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.88■■■■■ 6.38
ABCC9O60706 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC54.86■■■■■ 6.37
ABCC9O60706 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC54.86■■■■■ 6.37
ABCC9O60706 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC54.86■■■■■ 6.37
ABCC9O60706 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.84■■■■■ 6.37
ABCC9O60706 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.83■■■■■ 6.37
ABCC9O60706 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC54.83■■■■■ 6.37
ABCC9O60706 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC54.82■■■■■ 6.37
ABCC9O60706 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC54.81■■■■■ 6.37
ABCC9O60706 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC54.8■■■■■ 6.36
ABCC9O60706 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC54.8■■■■■ 6.36
ABCC9O60706 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC54.79■■■■■ 6.36
ABCC9O60706 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.78■■■■■ 6.36
ABCC9O60706 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.74■■■■■ 6.35
ABCC9O60706 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.74■■■■■ 6.35
ABCC9O60706 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC54.72■■■■■ 6.35
ABCC9O60706 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC54.71■■■■■ 6.35
ABCC9O60706 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.7■■■■■ 6.35
ABCC9O60706 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC54.68■■■■■ 6.34
ABCC9O60706 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.68■■■■■ 6.34
ABCC9O60706 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC54.68■■■■■ 6.34
ABCC9O60706 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC54.65■■■■■ 6.34
ABCC9O60706 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC54.62■■■■■ 6.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms