Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDF9O60383 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDF9O60383 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDF9O60383 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GDF9O60383 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GDF9O60383 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GDF9O60383 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GDF9O60383 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GDF9O60383 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GDF9O60383 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GDF9O60383 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GDF9O60383 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GDF9O60383 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GDF9O60383 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GDF9O60383 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GDF9O60383 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GDF9O60383 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDF9O60383 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDF9O60383 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDF9O60383 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDF9O60383 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF9O60383 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF9O60383 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF9O60383 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDF9O60383 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDF9O60383 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GDF9O60383 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GDF9O60383 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GDF9O60383 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GDF9O60383 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GDF9O60383 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GDF9O60383 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GDF9O60383 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GDF9O60383 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GDF9O60383 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GDF9O60383 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GDF9O60383 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GDF9O60383 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GDF9O60383 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GDF9O60383 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GDF9O60383 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GDF9O60383 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GDF9O60383 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GDF9O60383 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GDF9O60383 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GDF9O60383 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GDF9O60383 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GDF9O60383 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GDF9O60383 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GDF9O60383 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GDF9O60383 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GDF9O60383 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GDF9O60383 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GDF9O60383 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GDF9O60383 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GDF9O60383 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GDF9O60383 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GDF9O60383 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GDF9O60383 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GDF9O60383 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GDF9O60383 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GDF9O60383 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GDF9O60383 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDF9O60383 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GDF9O60383 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDF9O60383 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDF9O60383 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GDF9O60383 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDF9O60383 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GDF9O60383 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GDF9O60383 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GDF9O60383 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GDF9O60383 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GDF9O60383 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GDF9O60383 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GDF9O60383 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDF9O60383 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GDF9O60383 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GDF9O60383 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GDF9O60383 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GDF9O60383 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GDF9O60383 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GDF9O60383 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GDF9O60383 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GDF9O60383 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GDF9O60383 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GDF9O60383 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GDF9O60383 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GDF9O60383 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GDF9O60383 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GDF9O60383 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GDF9O60383 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GDF9O60383 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDF9O60383 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDF9O60383 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDF9O60383 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDF9O60383 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDF9O60383 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDF9O60383 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDF9O60383 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms