Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms