Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PSDA5PKW4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PSDA5PKW4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PSDA5PKW4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PSDA5PKW4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PSDA5PKW4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PSDA5PKW4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PSDA5PKW4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PSDA5PKW4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PSDA5PKW4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PSDA5PKW4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PSDA5PKW4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PSDA5PKW4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PSDA5PKW4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PSDA5PKW4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PSDA5PKW4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
PSDA5PKW4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PSDA5PKW4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PSDA5PKW4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PSDA5PKW4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PSDA5PKW4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PSDA5PKW4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PSDA5PKW4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
PSDA5PKW4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PSDA5PKW4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PSDA5PKW4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
PSDA5PKW4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PSDA5PKW4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PSDA5PKW4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PSDA5PKW4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PSDA5PKW4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PSDA5PKW4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
PSDA5PKW4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PSDA5PKW4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PSDA5PKW4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PSDA5PKW4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PSDA5PKW4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PSDA5PKW4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PSDA5PKW4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PSDA5PKW4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35■■■■□ 3.19
PSDA5PKW4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PSDA5PKW4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
PSDA5PKW4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
PSDA5PKW4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35■■■■□ 3.19
PSDA5PKW4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PSDA5PKW4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PSDA5PKW4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
PSDA5PKW4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PSDA5PKW4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PSDA5PKW4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PSDA5PKW4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PSDA5PKW4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PSDA5PKW4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PSDA5PKW4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PSDA5PKW4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PSDA5PKW4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PSDA5PKW4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PSDA5PKW4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PSDA5PKW4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PSDA5PKW4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PSDA5PKW4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PSDA5PKW4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PSDA5PKW4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PSDA5PKW4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PSDA5PKW4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PSDA5PKW4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PSDA5PKW4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PSDA5PKW4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PSDA5PKW4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PSDA5PKW4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PSDA5PKW4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PSDA5PKW4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PSDA5PKW4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PSDA5PKW4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PSDA5PKW4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PSDA5PKW4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PSDA5PKW4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PSDA5PKW4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PSDA5PKW4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PSDA5PKW4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PSDA5PKW4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PSDA5PKW4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PSDA5PKW4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PSDA5PKW4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PSDA5PKW4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PSDA5PKW4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PSDA5PKW4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PSDA5PKW4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PSDA5PKW4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PSDA5PKW4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PSDA5PKW4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PSDA5PKW4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PSDA5PKW4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PSDA5PKW4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PSDA5PKW4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PSDA5PKW4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PSDA5PKW4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PSDA5PKW4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PSDA5PKW4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PSDA5PKW4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms