Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms