Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms