Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC181Q5TID7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms