Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms