RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534208.5

NDUFS3-212, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene NDUFS3, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-212ENST00000534208 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.38■■■■■ 5.5
NDUFS3-212ENST00000534208 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.26■■■■■ 4.68
NDUFS3-212ENST00000534208 ABCC9O60706 1549 aa43.98■■■■■ 4.63
NDUFS3-212ENST00000534208 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.01■■■■■ 4.32
NDUFS3-212ENST00000534208 NACADO15069 1562 aa41.79■■■■■ 4.28
NDUFS3-212ENST00000534208 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.47■■■■■ 4.23
NDUFS3-212ENST00000534208 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.34■■■■■ 4.21
NDUFS3-212ENST00000534208 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.08■■■■■ 4.17
NDUFS3-212ENST00000534208 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.04■■■■■ 4.16
NDUFS3-212ENST00000534208 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
NDUFS3-212ENST00000534208 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.95■■■■■ 4.15
NDUFS3-212ENST00000534208 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.86■■■■■ 4.13
NDUFS3-212ENST00000534208 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.78■■■■■ 4.12
NDUFS3-212ENST00000534208 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.33■■■■■ 4.05
NDUFS3-212ENST00000534208 SCRIBQ14160 1630 aa40.26■■■■■ 4.04
NDUFS3-212ENST00000534208 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.77■■■■□ 3.96
NDUFS3-212ENST00000534208 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.95
NDUFS3-212ENST00000534208 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.63■■■■□ 3.94
NDUFS3-212ENST00000534208 NCAPD3P42695 1498 aa38.58■■■■□ 3.77
NDUFS3-212ENST00000534208 SMARCA4P51532 1647 aa38.47■■■■□ 3.75
NDUFS3-212ENST00000534208 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.47■■■■□ 3.75
NDUFS3-212ENST00000534208 SMARCA2P51531 1590 aa38.39■■■■□ 3.74
NDUFS3-212ENST00000534208 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.32■■■■□ 3.73
NDUFS3-212ENST00000534208 HMGXB3Q12766 1538 aa38.32■■■■□ 3.72
NDUFS3-212ENST00000534208 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.15■■■■□ 3.7
NDUFS3-212ENST00000534208 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.09■■■■□ 3.69
NDUFS3-212ENST00000534208 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.02■■■■□ 3.68
NDUFS3-212ENST00000534208 ERCC6Q03468 1493 aa37.96■■■■□ 3.67
NDUFS3-212ENST00000534208 CUX2O14529 1486 aa37.9■■■■□ 3.66
NDUFS3-212ENST00000534208 NESP48681 1621 aa37.83■■■■□ 3.65
NDUFS3-212ENST00000534208 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.67■■■■□ 3.62
NDUFS3-212ENST00000534208 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.63■■■■□ 3.61
NDUFS3-212ENST00000534208 WIZO95785 1651 aa37.56■■■■□ 3.6
NDUFS3-212ENST00000534208 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
NDUFS3-212ENST00000534208 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.44■■■■□ 3.58
NDUFS3-212ENST00000534208 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.4■■■■□ 3.58
NDUFS3-212ENST00000534208 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.37■■■■□ 3.57
NDUFS3-212ENST00000534208 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.32■■■■□ 3.56
NDUFS3-212ENST00000534208 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
NDUFS3-212ENST00000534208 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.09■■■■□ 3.53
NDUFS3-212ENST00000534208 CFTRP13569 1480 aa37.02■■■■□ 3.52
NDUFS3-212ENST00000534208 WDR62O43379 1518 aa37.02■■■■□ 3.52
NDUFS3-212ENST00000534208 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.98■■■■□ 3.51
NDUFS3-212ENST00000534208 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.95■■■■□ 3.51
NDUFS3-212ENST00000534208 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.7■■■■□ 3.47
NDUFS3-212ENST00000534208 PRDM2Q13029 1718 aa36.66■■■■□ 3.46
NDUFS3-212ENST00000534208 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
NDUFS3-212ENST00000534208 TOPBP1Q92547 1522 aa36.29■■■■□ 3.4
NDUFS3-212ENST00000534208 IFT140Q96RY7 1462 aa36.25■■■■□ 3.39
NDUFS3-212ENST00000534208 ABCC8Q09428 1581 aa36.25■■■■□ 3.39
NDUFS3-212ENST00000534208 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.18■■■■□ 3.38
NDUFS3-212ENST00000534208 OSCARQ8IYS5 282 aa36.16■■■■□ 3.38
NDUFS3-212ENST00000534208 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.38
NDUFS3-212ENST00000534208 TRIM41Q8WV44 630 aa35.97■■■■□ 3.35
NDUFS3-212ENST00000534208 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
NDUFS3-212ENST00000534208 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
NDUFS3-212ENST00000534208 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
NDUFS3-212ENST00000534208 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.83■■■■□ 3.335e-6■■□□□ 14.3
NDUFS3-212ENST00000534208 SOGA1O94964 1423 aa35.75■■■■□ 3.31
NDUFS3-212ENST00000534208 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.75■■■■□ 3.31
NDUFS3-212ENST00000534208 CUX1P39880 1505 aa35.72■■■■□ 3.31
NDUFS3-212ENST00000534208 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
NDUFS3-212ENST00000534208 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.71■■■■□ 3.31
NDUFS3-212ENST00000534208 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.66■■■■□ 3.3
NDUFS3-212ENST00000534208 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.66■■■■□ 3.3
NDUFS3-212ENST00000534208 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.66■■■■□ 3.3
NDUFS3-212ENST00000534208 WDR97A6NE52 1622 aa35.65■■■■□ 3.3
NDUFS3-212ENST00000534208 CHD1O14646 1710 aa35.64■■■■□ 3.3
NDUFS3-212ENST00000534208 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
NDUFS3-212ENST00000534208 ARHGEF11O15085 1522 aa35.58■■■■□ 3.29
NDUFS3-212ENST00000534208 FBLN2P98095 1184 aa35.5■■■■□ 3.27
NDUFS3-212ENST00000534208 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.48■■■■□ 3.27
NDUFS3-212ENST00000534208 GRIN2BQ13224 1484 aa35.44■■■■□ 3.26
NDUFS3-212ENST00000534208 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
NDUFS3-212ENST00000534208 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.36■■■■□ 3.25
NDUFS3-212ENST00000534208 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.33■■■■□ 3.25
NDUFS3-212ENST00000534208 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
NDUFS3-212ENST00000534208 SYNJ2O15056 1496 aa35.3■■■■□ 3.24
NDUFS3-212ENST00000534208 PBRM1Q86U86 1689 aa35.29■■■■□ 3.24
NDUFS3-212ENST00000534208 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.28■■■■□ 3.24
NDUFS3-212ENST00000534208 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.28■■■■□ 3.24
NDUFS3-212ENST00000534208 SYNJ1O43426 1573 aa35.26■■■■□ 3.24
NDUFS3-212ENST00000534208 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.26■■■■□ 3.24
NDUFS3-212ENST00000534208 ARAP1Q96P48 1450 aa35.24■■■■□ 3.23
NDUFS3-212ENST00000534208 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.23■■■■□ 3.23
NDUFS3-212ENST00000534208 TOP2BQ02880 1626 aa35.22■■■■□ 3.23
NDUFS3-212ENST00000534208 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.22■■■■□ 3.23
NDUFS3-212ENST00000534208 ADAMTS12P58397 1594 aa34.99■■■■□ 3.19
NDUFS3-212ENST00000534208 GRIN2AQ12879 1464 aa34.97■■■■□ 3.19
NDUFS3-212ENST00000534208 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.92■■■■□ 3.18
NDUFS3-212ENST00000534208 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.9■■■■□ 3.18
NDUFS3-212ENST00000534208 NUP160Q12769 1436 aa34.88■■■■□ 3.17
NDUFS3-212ENST00000534208 CEP170Q5SW79 1584 aa34.83■■■■□ 3.17
NDUFS3-212ENST00000534208 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
NDUFS3-212ENST00000534208 SHROOM2Q13796 1616 aa34.7■■■■□ 3.15
NDUFS3-212ENST00000534208 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.7■■■■□ 3.14
NDUFS3-212ENST00000534208 KIF27Q86VH2 1401 aa34.53■■■■□ 3.12
NDUFS3-212ENST00000534208 IGF1RP08069 1367 aa34.49■■■■□ 3.11
NDUFS3-212ENST00000534208 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.49■■■■□ 3.11
NDUFS3-212ENST00000534208 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7 ms