Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q3C1V9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q3C1V9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q3C1V9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q3C1V9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q3C1V9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q3C1V9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Q3C1V9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q3C1V9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q3C1V9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q3C1V9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q3C1V9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q3C1V9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q3C1V9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q3C1V9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3C1V9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3C1V9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3C1V9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3C1V9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3C1V9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3C1V9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3C1V9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3C1V9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3C1V9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3C1V9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3C1V9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3C1V9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3C1V9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3C1V9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3C1V9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3C1V9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3C1V9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3C1V9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3C1V9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3C1V9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3C1V9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3C1V9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3C1V9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3C1V9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3C1V9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3C1V9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3C1V9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3C1V9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3C1V9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3C1V9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3C1V9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3C1V9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3C1V9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3C1V9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3C1V9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3C1V9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3C1V9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3C1V9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3C1V9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3C1V9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3C1V9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3C1V9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3C1V9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3C1V9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3C1V9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3C1V9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3C1V9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3C1V9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3C1V9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3C1V9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3C1V9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3C1V9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3C1V9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3C1V9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3C1V9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3C1V9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3C1V9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3C1V9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3C1V9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3C1V9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3C1V9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3C1V9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3C1V9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3C1V9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q3C1V9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.5 ms