Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KPNA2P52292 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms