Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00271P0C7V0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms