Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC78A2IDD5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms