Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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