Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COPG2Q9UBF2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPG2Q9UBF2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPG2Q9UBF2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
COPG2Q9UBF2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPG2Q9UBF2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPG2Q9UBF2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPG2Q9UBF2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPG2Q9UBF2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPG2Q9UBF2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPG2Q9UBF2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms