Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CA9Q16790 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CA9Q16790 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CA9Q16790 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CA9Q16790 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CA9Q16790 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CA9Q16790 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CA9Q16790 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CA9Q16790 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CA9Q16790 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CA9Q16790 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CA9Q16790 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CA9Q16790 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CA9Q16790 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CA9Q16790 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CA9Q16790 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CA9Q16790 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CA9Q16790 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CA9Q16790 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CA9Q16790 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CA9Q16790 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CA9Q16790 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CA9Q16790 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CA9Q16790 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CA9Q16790 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CA9Q16790 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CA9Q16790 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CA9Q16790 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CA9Q16790 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CA9Q16790 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CA9Q16790 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CA9Q16790 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CA9Q16790 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CA9Q16790 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CA9Q16790 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CA9Q16790 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CA9Q16790 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CA9Q16790 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CA9Q16790 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CA9Q16790 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CA9Q16790 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CA9Q16790 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CA9Q16790 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CA9Q16790 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CA9Q16790 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CA9Q16790 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CA9Q16790 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CA9Q16790 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CA9Q16790 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CA9Q16790 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CA9Q16790 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CA9Q16790 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CA9Q16790 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CA9Q16790 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CA9Q16790 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CA9Q16790 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CA9Q16790 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CA9Q16790 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CA9Q16790 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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