Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00271P0C7V0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms