Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNE2O96020 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNE2O96020 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNE2O96020 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNE2O96020 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE2O96020 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE2O96020 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE2O96020 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE2O96020 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE2O96020 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE2O96020 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE2O96020 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE2O96020 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms