Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QLW9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QLW9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QLW9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QLW9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QLW9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QLW9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QLW9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QLW9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QLW9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QLW9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QLW9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QLW9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QLW9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QLW9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QLW9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QLW9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QLW9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QLW9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QLW9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QLW9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QLW9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QLW9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QLW9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QLW9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QLW9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QLW9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QLW9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QLW9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QLW9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QLW9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QLW9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QLW9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QLW9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QLW9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QLW9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QLW9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QLW9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QLW9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QLW9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QLW9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QLW9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QLW9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QLW9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QLW9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QLW9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QLW9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QLW9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QLW9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3QLW9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
J3QLW9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QLW9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QLW9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QLW9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QLW9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QLW9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QLW9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms