Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNPLA3Q9NST1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms