Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PPARGC1BQ86YN6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms