Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3KQ59H18 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms