Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NID2Q14112 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NID2Q14112 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NID2Q14112 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NID2Q14112 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NID2Q14112 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NID2Q14112 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NID2Q14112 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NID2Q14112 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NID2Q14112 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NID2Q14112 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NID2Q14112 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NID2Q14112 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NID2Q14112 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NID2Q14112 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NID2Q14112 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NID2Q14112 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NID2Q14112 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NID2Q14112 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NID2Q14112 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NID2Q14112 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NID2Q14112 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NID2Q14112 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NID2Q14112 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NID2Q14112 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NID2Q14112 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NID2Q14112 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NID2Q14112 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NID2Q14112 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NID2Q14112 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NID2Q14112 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NID2Q14112 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NID2Q14112 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NID2Q14112 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NID2Q14112 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NID2Q14112 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NID2Q14112 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NID2Q14112 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NID2Q14112 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NID2Q14112 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NID2Q14112 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NID2Q14112 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NID2Q14112 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NID2Q14112 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NID2Q14112 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NID2Q14112 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NID2Q14112 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NID2Q14112 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NID2Q14112 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NID2Q14112 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NID2Q14112 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NID2Q14112 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NID2Q14112 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NID2Q14112 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NID2Q14112 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NID2Q14112 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NID2Q14112 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NID2Q14112 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NID2Q14112 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NID2Q14112 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NID2Q14112 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NID2Q14112 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NID2Q14112 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NID2Q14112 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NID2Q14112 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NID2Q14112 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NID2Q14112 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NID2Q14112 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NID2Q14112 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NID2Q14112 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NID2Q14112 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NID2Q14112 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NID2Q14112 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NID2Q14112 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NID2Q14112 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NID2Q14112 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NID2Q14112 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NID2Q14112 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NID2Q14112 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NID2Q14112 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NID2Q14112 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NID2Q14112 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NID2Q14112 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NID2Q14112 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NID2Q14112 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NID2Q14112 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NID2Q14112 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NID2Q14112 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NID2Q14112 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NID2Q14112 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NID2Q14112 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NID2Q14112 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NID2Q14112 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NID2Q14112 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NID2Q14112 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NID2Q14112 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NID2Q14112 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NID2Q14112 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NID2Q14112 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NID2Q14112 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms