Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 YPL109CYPL109C 1974 nt3.58□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 LCB5YLR260W 2064 nt3.58□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 TCB3YML072C 4638 nt3.58□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 RIM1YCR028C-A 408 nt3.58□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 TAD1YGL243W 1203 nt3.58□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 RPN13YLR421C 471 nt3.58□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YMR310CYMR310C 954 nt3.58□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 SPH1YLR313C 1593 nt3.58□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 SPT10YJL127C 1923 nt3.58□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YOR365CYOR365C 2112 nt3.58□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 CDC37YDR168W 1521 nt3.57□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YAP6YDR259C 1152 nt3.57□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 MXR1YER042W 555 nt3.57□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 RNR1YER070W 2667 nt3.57□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 BI2Q0110 1272 nt3.57□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 TAN1YGL232W 870 nt3.57□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 RRN6YBL014C 2685 nt3.57□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 MIX23YBL107C 591 nt3.57□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YOR022CYOR022C 2148 nt3.57□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YOR387CYOR387C 621 nt3.57□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 MSD1YPL104W 1977 nt3.57□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YPR078CYPR078C 1119 nt3.57□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 SYT1YPR095C 3681 nt3.57□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 MRPL51YPR100W 423 nt3.57□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 ACK1YDL203C 1872 nt3.56□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 CPA2YJR109C 3357 nt3.56□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 GSC2YGR032W 5688 nt3.56□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 TMA108YIL137C 2841 nt3.56□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 UBX3YDL091C 1368 nt3.56□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 MFB1YDR219C 1398 nt3.56□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 NSA1YGL111W 1392 nt3.56□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YLR446WYLR446W 1302 nt3.56□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 DPP1YDR284C 870 nt3.56□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YDR355CYDR355C 303 nt3.56□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 RMD6YEL072W 696 nt3.56□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 RPS0AYGR214W 759 nt3.56□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 IRC18YJL037W 675 nt3.56□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 ATG27YJL178C 816 nt3.56□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YKR011CYKR011C 1062 nt3.56□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 ERP1YAR002C-A 660 nt3.56□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YBL055CYBL055C 1257 nt3.56□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YOL029CYOL029C 606 nt3.56□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 ENP2YGR145W 2124 nt3.56□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 HDA2YDR295C 2025 nt3.56□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 MSS4YDR208W 2340 nt3.55□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 TAF1YGR274C 3201 nt3.55□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 snR84snR84 550 nt3.55□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 GIM4YEL003W 336 nt3.55□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YGR042WYGR042W 816 nt3.55□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 GEP4YHR100C 558 nt3.55□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YPT35YHR105W 645 nt3.55□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 SOP4YJL192C 705 nt3.55□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YJR087WYJR087W 351 nt3.55□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 GIM3YNL153C 390 nt3.55□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 PIN3YPR154W 648 nt3.55□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YBR090CYBR090C 369 nt3.55□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 MTL1YGR023W 1656 nt3.55□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YLR177WYLR177W 1887 nt3.54□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 NTH1YDR001C 2256 nt3.54□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YPR003CYPR003C 2265 nt3.54□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 ENT3YJR125C 1227 nt3.54□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt3.54□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 ECM13YBL043W 774 nt3.54□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YPL088WYPL088W 1029 nt3.54□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YPR136CYPR136C 513 nt3.54□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 TRK1YJL129C 3708 nt3.54□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 OSH3YHR073W 2991 nt3.54□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 AI4Q0065 1671 nt3.53□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt3.53□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YDR491CYDR491C 492 nt3.53□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt3.53□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 TMA20YER007C-A 546 nt3.53□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 RGI1YER067W 486 nt3.53□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 LOC1YFR001W 615 nt3.53□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YGL159WYGL159W 1113 nt3.53□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 MIG2YGL209W 1149 nt3.53□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YGR018CYGR018C 330 nt3.53□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YLR050CYLR050C 486 nt3.53□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 RIM11YMR139W 1113 nt3.53□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YMR144WYMR144W 1029 nt3.53□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YMR254CYMR254C 309 nt3.53□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 YPL205CYPL205C 345 nt3.53□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 ASI1YMR119W 1875 nt3.53□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 NOP56YLR197W 1515 nt3.53□□□□□ -1.84
UBX3Q12229 VPS17YOR132W 1656 nt3.52□□□□□ -1.85
UBX3Q12229 NGG1YDR176W 2109 nt3.52□□□□□ -1.85
UBX3Q12229 SLF1YDR515W 1344 nt3.52□□□□□ -1.85
UBX3Q12229 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.52□□□□□ -1.85
UBX3Q12229 ALA1YOR335C 2877 nt3.52□□□□□ -1.85
UBX3Q12229 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.52□□□□□ -1.85
UBX3Q12229 MAM1YER106W 909 nt3.52□□□□□ -1.85
UBX3Q12229 YGL082WYGL082W 1146 nt3.52□□□□□ -1.85
UBX3Q12229 AML1YGR001C 747 nt3.52□□□□□ -1.85
UBX3Q12229 YIL161WYIL161W 708 nt3.52□□□□□ -1.85
UBX3Q12229 SGN1YIR001C 753 nt3.52□□□□□ -1.85
UBX3Q12229 YJL114WYJL114W 681 nt3.52□□□□□ -1.85
UBX3Q12229 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt3.52□□□□□ -1.85
UBX3Q12229 YJL175WYJL175W 513 nt3.52□□□□□ -1.85
UBX3Q12229 ATP11YNL315C 957 nt3.52□□□□□ -1.85
UBX3Q12229 GRX7YBR014C 612 nt3.52□□□□□ -1.85
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