Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ITGAEP38570 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
ITGAEP38570 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms