Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP5A1P25705 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms