Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RXRAP19793 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RXRAP19793 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
RXRAP19793 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRAP19793 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRAP19793 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRAP19793 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRAP19793 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRAP19793 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRAP19793 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRAP19793 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRAP19793 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRAP19793 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRAP19793 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRAP19793 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRAP19793 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRAP19793 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRAP19793 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRAP19793 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRAP19793 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRAP19793 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRAP19793 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRAP19793 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRAP19793 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRAP19793 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRAP19793 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRAP19793 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRAP19793 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRAP19793 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRAP19793 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRAP19793 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRAP19793 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRAP19793 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRAP19793 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRAP19793 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRAP19793 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRAP19793 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRAP19793 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRAP19793 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRAP19793 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRAP19793 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRAP19793 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRAP19793 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRAP19793 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRAP19793 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRAP19793 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRAP19793 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRAP19793 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRAP19793 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRAP19793 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRAP19793 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRAP19793 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRAP19793 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRAP19793 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRAP19793 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRAP19793 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRAP19793 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRAP19793 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRAP19793 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RXRAP19793 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RXRAP19793 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RXRAP19793 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RXRAP19793 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RXRAP19793 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RXRAP19793 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RXRAP19793 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RXRAP19793 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RXRAP19793 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RXRAP19793 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RXRAP19793 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RXRAP19793 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RXRAP19793 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RXRAP19793 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RXRAP19793 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RXRAP19793 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RXRAP19793 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RXRAP19793 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RXRAP19793 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RXRAP19793 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RXRAP19793 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms