Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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