Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN3Q16667 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN3Q16667 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN3Q16667 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN3Q16667 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN3Q16667 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN3Q16667 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN3Q16667 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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