Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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