Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NID2Q14112 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NID2Q14112 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NID2Q14112 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NID2Q14112 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NID2Q14112 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NID2Q14112 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NID2Q14112 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NID2Q14112 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NID2Q14112 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NID2Q14112 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NID2Q14112 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NID2Q14112 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NID2Q14112 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NID2Q14112 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NID2Q14112 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NID2Q14112 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NID2Q14112 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NID2Q14112 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NID2Q14112 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NID2Q14112 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NID2Q14112 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NID2Q14112 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NID2Q14112 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NID2Q14112 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NID2Q14112 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NID2Q14112 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NID2Q14112 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NID2Q14112 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NID2Q14112 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NID2Q14112 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NID2Q14112 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NID2Q14112 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NID2Q14112 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NID2Q14112 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NID2Q14112 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NID2Q14112 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NID2Q14112 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NID2Q14112 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NID2Q14112 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NID2Q14112 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NID2Q14112 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NID2Q14112 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NID2Q14112 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NID2Q14112 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NID2Q14112 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NID2Q14112 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NID2Q14112 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NID2Q14112 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NID2Q14112 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NID2Q14112 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NID2Q14112 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NID2Q14112 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NID2Q14112 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NID2Q14112 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NID2Q14112 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NID2Q14112 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NID2Q14112 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NID2Q14112 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NID2Q14112 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NID2Q14112 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NID2Q14112 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NID2Q14112 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NID2Q14112 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NID2Q14112 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NID2Q14112 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NID2Q14112 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NID2Q14112 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NID2Q14112 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NID2Q14112 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NID2Q14112 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NID2Q14112 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NID2Q14112 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NID2Q14112 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NID2Q14112 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NID2Q14112 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NID2Q14112 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NID2Q14112 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NID2Q14112 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NID2Q14112 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NID2Q14112 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NID2Q14112 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NID2Q14112 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NID2Q14112 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NID2Q14112 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NID2Q14112 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NID2Q14112 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NID2Q14112 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NID2Q14112 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NID2Q14112 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NID2Q14112 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NID2Q14112 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NID2Q14112 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NID2Q14112 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NID2Q14112 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NID2Q14112 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NID2Q14112 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NID2Q14112 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NID2Q14112 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NID2Q14112 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
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