Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 DSE1YER124C 1722 nt3.65□□□□□ -1.82
UBX3Q12229 DBP3YGL078C 1572 nt3.65□□□□□ -1.82
UBX3Q12229 YCR085WYCR085W 354 nt3.65□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 HMO1YDR174W 741 nt3.65□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 RSM18YER050C 417 nt3.65□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt3.65□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 BET4YJL031C 984 nt3.65□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 SFT1YKL006C-A 294 nt3.65□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 YPT7YML001W 627 nt3.65□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 PET123YOR158W 957 nt3.65□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 YOR263CYOR263C 408 nt3.65□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 USV1YPL230W 1176 nt3.65□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 MNL1YHR204W 2391 nt3.65□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 CHD1YER164W 4407 nt3.64□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 ARP9YMR033W 1404 nt3.64□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 YCR001WYCR001W 315 nt3.64□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 PHM6YDR281C 315 nt3.64□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 RPF1YHR088W 888 nt3.64□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 MED11YMR112C 396 nt3.64□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 TRM112YNR046W 408 nt3.64□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 BUD21YOR078W 645 nt3.64□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 YOL019WYOL019W 1656 nt3.64□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 IOC2YLR095C 2439 nt3.64□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 TSC13YDL015C 933 nt3.63□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 YDL016CYDL016C 303 nt3.63□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 FCF1YDR339C 570 nt3.63□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 YGL074CYGL074C 327 nt3.63□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 YGR126WYGR126W 693 nt3.63□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 IRC9YJL142C 393 nt3.63□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 IME1YJR094C 1083 nt3.63□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt3.63□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 MEI5YPL121C 669 nt3.63□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 snR17asnR17a 333 nt3.63□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 TRM12YML005W 1389 nt3.63□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 AEP2YMR282C 1743 nt3.62□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 CTM1YHR109W 1758 nt3.62□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 APA2YDR530C 978 nt3.62□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 MND1YGL183C 660 nt3.62□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 YGR290WYGR290W 444 nt3.62□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 TPM1YNL079C 600 nt3.62□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 YSF3YNL138W-A 258 nt3.62□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 BRX1YOL077C 876 nt3.62□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 RCN2YOR220W 798 nt3.62□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 RFC5YBR087W 1065 nt3.62□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 TRM82YDR165W 1335 nt3.62□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 RPO31YOR116C 4383 nt3.62□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 GYP6YJL044C 1377 nt3.62□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 SSL1YLR005W 1386 nt3.62□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 DSS1YMR287C 2910 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 BUD27YFL023W 2391 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 RDS1YCR106W 2499 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 GRS2YPR081C 1857 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 SEC59YMR013C 1560 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 TRX3YCR083W 384 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 DTD1YDL219W 453 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 SEC53YFL045C 765 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 RPS25AYGR027C 327 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 YGR160WYGR160W 612 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 DPH1YIL103W 1278 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 ECI1YLR284C 843 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 HNT3YOR258W 654 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 SCD6YPR129W 1050 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 DER1YBR201W 636 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 CTP1YBR291C 900 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 GCN5YGR252W 1320 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 YPR148CYPR148C 1308 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 AGE1YDR524C 1449 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 APE2YKL157W 2859 nt3.61□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 AIP1YMR092C 1848 nt3.6□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 KEI1YDR367W 666 nt3.6□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 DIG2YDR480W 972 nt3.6□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 IES6YEL044W 501 nt3.6□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 LIN1YHR156C 1023 nt3.6□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 CCE1YKL011C 1062 nt3.6□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 SDS22YKL193C 1017 nt3.6□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 COX19YLL018C-A 297 nt3.6□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 GMC2YLR445W 567 nt3.6□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 SPC29YPL124W 762 nt3.6□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt3.6□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.6□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 UBX5YDR330W 1503 nt3.6□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 SPR3YGR059W 1539 nt3.6□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 CEX1YOR112W 2286 nt3.59□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 HCA4YJL033W 2313 nt3.59□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 PRP11YDL043C 801 nt3.59□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 TGL2YDR058C 981 nt3.59□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt3.59□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 PDX1YGR193C 1233 nt3.59□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 MRPL9YGR220C 810 nt3.59□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt3.59□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 YIR014WYIR014W 729 nt3.59□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 YJR141WYJR141W 1044 nt3.59□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 PRM6YML047C 1059 nt3.59□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 GIM5YML094W 492 nt3.59□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 CAF20YOR276W 486 nt3.59□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 RSA1YPL193W 1146 nt3.59□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 DIB1YPR082C 432 nt3.59□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 POL30YBR088C 777 nt3.59□□□□□ -1.83
UBX3Q12229 SPT6YGR116W 4356 nt3.59□□□□□ -1.84
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