RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W MTC1P47018 478 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HCA4YJL033W DRS1P32892 752 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
HCA4YJL033W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
HCA4YJL033W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
HCA4YJL033W FAP1P53971 965 aa9.96□□□□□ -0.81
HCA4YJL033W AVT3P36062 692 aa9.89□□□□□ -0.83
HCA4YJL033W ISW2Q08773 1120 aa9.74□□□□□ -0.85
HCA4YJL033W PRI1P10363 409 aa9.65□□□□□ -0.86
HCA4YJL033W RPG1P38249 964 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HCA4YJL033W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
HCA4YJL033W AAD16Q02895 342 aa9.51□□□□□ -0.89
HCA4YJL033W TFA1P36100 482 aa9.39□□□□□ -0.91
HCA4YJL033W PRY3P47033 881 aa9.32□□□□□ -0.92
HCA4YJL033W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
HCA4YJL033W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
HCA4YJL033W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
HCA4YJL033W REB1P21538 810 aa9.14□□□□□ -0.95
HCA4YJL033W SPT21P35209 758 aa8.85□□□□□ -0.99
HCA4YJL033W MRPL32P25348 183 aa8.82□□□□□ -1
HCA4YJL033W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
HCA4YJL033W YCK3P39962 524 aa8.76□□□□□ -1.01
HCA4YJL033W RIM101P33400 625 aa8.7□□□□□ -1.02
HCA4YJL033W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HCA4YJL033W CDC27P38042 758 aa8.45□□□□□ -1.06
HCA4YJL033W TFC8Q12308 588 aa8.43□□□□□ -1.06
HCA4YJL033W HOP09932 586 aa8.42□□□□□ -1.06
HCA4YJL033W OXP1P28273 1286 aa8.41□□□□□ -1.06
HCA4YJL033W DCD1P06773 312 aa8.35□□□□□ -1.07
HCA4YJL033W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
HCA4YJL033W YGL015CP33199 130 aa8.29□□□□□ -1.08
HCA4YJL033W PTP3P40048 928 aa8.29□□□□□ -1.08
HCA4YJL033W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
HCA4YJL033W SSP1P38871 571 aa8.25□□□□□ -1.09
HCA4YJL033W RSM7P47150 247 aa8.19□□□□□ -1.1
HCA4YJL033W BCH2P36122 765 aa8.18□□□□□ -1.1
HCA4YJL033W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HCA4YJL033W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data8.16□□□□□ -1.1not detected
HCA4YJL033W YLR271WQ06152 274 aa8.15□□□□□ -1.1
HCA4YJL033W MAP2P38174 421 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
HCA4YJL033W SCY1P53009 804 aa8.09□□□□□ -1.11
HCA4YJL033W AI2P03876 854 aa8.06□□□□□ -1.12
HCA4YJL033W BBC1P47068 1157 aa8.05□□□□□ -1.12
HCA4YJL033W EPS1P40557 701 aa8.03□□□□□ -1.12
HCA4YJL033W MGA2P40578 1113 aa7.98□□□□□ -1.13
HCA4YJL033W BDF1P35817 686 aa7.98□□□□□ -1.13
HCA4YJL033W SLX5P32828 619 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
HCA4YJL033W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
HCA4YJL033W CST9Q06032 482 aa7.89□□□□□ -1.15
HCA4YJL033W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
HCA4YJL033W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
HCA4YJL033W MRM1P25270 412 aa7.8□□□□□ -1.16
HCA4YJL033W TGL3P40308 642 aa7.79□□□□□ -1.16
HCA4YJL033W RTG3P38165 486 aa7.7□□□□□ -1.18
HCA4YJL033W DMA1P38823 416 aa7.66□□□□□ -1.18
HCA4YJL033W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data7.65□□□□□ -1.18not detected
HCA4YJL033W RCR1P38212 213 aa7.63□□□□□ -1.19
HCA4YJL033W VPS29P38759 282 aa7.61□□□□□ -1.19
HCA4YJL033W YAP5P40574 245 aa7.61□□□□□ -1.19
HCA4YJL033W RAM2P29703 316 aa7.59□□□□□ -1.19
HCA4YJL033W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data7.58□□□□□ -1.2not detected
HCA4YJL033W YOR238WQ08634 303 aa7.57□□□□□ -1.2
HCA4YJL033W MST1P07236 462 aa7.53□□□□□ -1.2
HCA4YJL033W MAK11P20484 414 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
HCA4YJL033W DBP1P24784 617 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
HCA4YJL033W STS1P38637 319 aa7.5□□□□□ -1.21
HCA4YJL033W YFR006WP43590 535 aa7.49□□□□□ -1.21
HCA4YJL033W PIB1Q06651 286 aa7.47□□□□□ -1.21
HCA4YJL033W GTT3P39996 337 aa7.42□□□□□ -1.22
HCA4YJL033W SET1P38827 1080 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HCA4YJL033W COQ8P27697 501 aa7.4□□□□□ -1.22
HCA4YJL033W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HCA4YJL033W MIF2P35201 549 aa7.39□□□□□ -1.23
HCA4YJL033W UBP9P39967 754 aa7.38□□□□□ -1.23
HCA4YJL033W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HCA4YJL033W EDS1P38073 919 aa7.33□□□□□ -1.24
HCA4YJL033W IFH1P39520 1085 aa7.33□□□□□ -1.24
HCA4YJL033W SAM3Q08986 587 aa7.33□□□□□ -1.24
HCA4YJL033W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
HCA4YJL033W PTC3P34221 468 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HCA4YJL033W WSC3Q12215 556 aa7.29□□□□□ -1.24
HCA4YJL033W YBL029C-AQ3E756 94 aa7.29□□□□□ -1.24
HCA4YJL033W YPR148CQ06523 435 aa7.28□□□□□ -1.24
HCA4YJL033W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HCA4YJL033W YOL036WQ08206 761 aa7.27□□□□□ -1.25
HCA4YJL033W MSB4Q12317 492 aa7.27□□□□□ -1.25
HCA4YJL033W VNX1P42839 908 aa7.26□□□□□ -1.25
HCA4YJL033W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HCA4YJL033W GYP5Q12344 894 aa7.26□□□□□ -1.25
HCA4YJL033W SET4P42948 560 aa7.25□□□□□ -1.25
HCA4YJL033W ATH1P48016 1211 aa7.25□□□□□ -1.25
HCA4YJL033W ABP1P15891 592 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HCA4YJL033W GUT1P32190 709 aa7.23□□□□□ -1.25
HCA4YJL033W VPS70P47161 811 aa7.22□□□□□ -1.25
HCA4YJL033W EAP1P36041 632 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HCA4YJL033W SPP1Q03012 353 aa7.21□□□□□ -1.26
HCA4YJL033W TIF11P38912 153 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HCA4YJL033W CKB1P43639 278 aa7.19□□□□□ -1.26
HCA4YJL033W DCW1P36091 449 aa7.18□□□□□ -1.26
HCA4YJL033W HTA1P04911 132 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HCA4YJL033W HTA2P04912 132 aa7.18□□□□□ -1.26
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